 Sebastian Bittrich
|
87390afbd9
resolves conflict with master
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
3b00d25c96
more memory-efficient way to store atom radii
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
81732b1e56
testPoint is now defined outside of loop
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
4d94a6688a
improved handling of modified residues
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
5b8471bcbd
lookup3d at structure level, color provider
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
c2af2cdb03
removes random OS file from project
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
05a4321d33
unbiased VDW radius assignment for non-polymer atoms
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
fb60cb589d
stub to consider non-polymer groups for computation
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
91fff322ac
support for nucleotides
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
472ee474ed
respect for BioJava
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
94155295a1
actually initializes arrays, a strict requirement to get results
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
5cc1d65032
adds stub for buried state flag
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
380fd092f9
establishes PD handling of parameters
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
0c3d4b4ce1
removes safety net to avoid dying for 3j3q
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
cf993ab0cd
better add files to commit
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
e02fefa6b4
4x speedup by limiting # of sphere points to original value
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
696b188b91
wrong assignment of values resolved
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
623009b29c
ASA calc now uses lookup3d and ties results to atoms and residues
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
e403c371e9
cleanup
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
a040cde904
allows for ASA visualization by really dirty means
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
e5b6ac3996
normalization of ASA values
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
0bd7bdfe9f
summing up ASA values for residues
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
e8e79ab06c
calculation of atom ASA
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
e94d3a6929
employs switch-case for radii determination
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
8d2ba31a0b
computation of atom radii
|
преди 6 години |
|
Sebastian Bittrich
|
d48efc696a
color provider for accessible surface area
|
преди 6 години |
|
Alexander Rose
|
2325ac9ad4
fixed wrong PNA backboneEnd atom name
|
преди 6 години |
|
Alexander Rose
|
5152e27de0
fix DirectVolumeVisual VolumeVisual creation
|
преди 6 години |
|
Alexander Rose
|
e7defe5258
fixed isoValue equality checking
|
преди 6 години |
|
Alexander Rose
|
0097886292
Merge branch 'gl-geo'
|
преди 6 години |
